1970年初，学校迁至安徽省合肥市，开始了第二次创业。1978年以后，学校锐意改革，大胆创新，在全国率先提出并实施了一系列具有创新精神和前瞻意识的教育改革和开放新举措，得到迅速恢复和发展。学校在“七五”、“八五”期间一直得到国家的重点建设，很快发展成为国家高质量人才培养和高水平科学研究的重要基地。邓小平同志曾称赞：“科技大学办得较好，年轻人才较多”。

        20世纪90年代以来，学校抓住世纪之交的历史机遇，主动适应国内外科技、教育和社会经济发展的要求与挑战，认真贯彻《中国教育改革和发展纲要》，大力推行教学科研改革和结构性调整，进行第三次创业。“九五”期间，学校是全国首批获准进行“211工程”建设的大学之一。1998年6月，江泽民同志为中国科大建校四十周年题词：“面向二十一世纪，建设一流大学，培育一流人才”。 1999年7月，中国科学院、教育部、安徽省人民政府签署重点共建中国科大协议，决定共同加大力度支持学校在21世纪初建成世界知名的高水平研究型大学。 1998年开始，学校积极参与中国科学院知识创新试点工程，并于2001年整体进入全面推进阶段建设序列。2002年9月，学校经国家批准，启动实施“十五”“211工程”建设。

    学校现任名誉校长是原全国人大常委会副委员长、中国科协主席、中国科学院院士周光召教授，党委书记是郭传杰研究员，校长是中国科学院院士、第三世界科学院院士、化学家朱清时教授。

    学校有8个学院、24个系和少年班、教改试点班，以及研究生院、软件学院、继续教育学院、网络教育学院等，与中国科学院合肥研究院联合成立了中国科大高等研究院，在苏州、上海分别设有研究院。有37个本科专业，17个一级学科博士学位授权点，93个二级学科博士学位授权点，109个二级学科硕士学位授权点，有工商管理（MBA）、公共管理（MPA）和工程硕士3个专业硕士学位授权点；17个博士后流动站，48个博士后流动站学科专业，具备培养学士-硕士-博士的完整教育体系，是中国科学院博士生重点培养基地。有数学、物理学、力学3个国家理科基础科学研究和教学人才培养基地以及生命科学与技术国家人才培养基地，基础数学等19个国家重点学科，计算数学等19个安徽省重点学科。已建成国家同步辐射实验室、火灾科学国家重点实验室以及国家高性能计算中心（合肥），于2003年11月获准筹建合肥微尺度物质科学国家实验室；拥有选键化学、结构分析、结构生物学、材料力学行为和设计、量子信息、壳幔物质与环境、基础等离子体物理7个中国科学院重点实验室和中国科学院热安全工程技术研究中心以及5个安徽省重点实验室和安徽省高校人文社科重点研究基地等一批重点科研机构。

    学校有教职工3500多人，其中教师1100人，专职研究人员330人。有中国科学院和中国工程院院士25人，第三世界科学院院士3人，博士生导师347人，教授471人（含研究员、教授级高级工程师），副教授801人（含副研究员、高级工程师、高级实验师），另有博士后研究人员150人。中青年教师占教师总数的80%以上，他们锐意进取，大胆创新，充满朝气与活力，许多人已是国内外知名的学术带头人和教学科研骨干。

    学校普通高等教育在校生13806人，其中博士生1759人，硕士生4557人，本科生7490人；另有专业学位硕士生2480人，各类成人高等学历教育在学学生2386人。本科生生源和培养质量一直在全国高校中名列前茅。

    校园总面积133万平方米，建筑面积85万平方米，拥有资产总值约6亿元的先进教学科研仪器设备，图书馆藏书162万册，已建成国内一流水平的校园计算机网络，初步建成理化科学、生命科学、信息科学、工程和材料科学4个设备优良、管理先进、开放使用的科研、教学公共实验中心。

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